La calidad es un requisito indispensable de un buen estudio de laboratorio, por lo que el hospital lleva a cabo controles internos de calidad. Continuamente efectúa revisiones internas que se ven reforzadas con supervisiones externas, a través de instituciones certificadas como lo es el PACAL.

PACAL es un Programa de Aseguramiento de la Calidad, y a la vez un organismo mexicano certificado internacionalmente en ISO 9001-2008 y reconocido por la entidad mexicana de acreditación como proveedor de ensayos de aptitud, encargado de evaluar la certeza en los resultados de los estudios de laboratorio, a nivel nacional a 2500 laboratorios de análisis clínicos, tanto públicos como privados. Dentro de este grupo  se encuentra el del Centro Médico de Toluca.

En Noviembre del 2010 PACAL y la UNAM, realizaron su PRIMER ENCUENTRO INTERNACIONAL SOBRE EL CONTROL DE LA CALIDAD EN EL LABORATORIO CLÍNICO, escenario en el que fueron entregados los reconocimientos y diplomas a la calidad. En este encuentro el hospital recibió:

• EL DIPLOMA POR HABER CALIFICADO CON EXCELENCIA EN LA CALIDAD DURANTE EL AÑO 2010, EN LAS SECCIONES: QUÍMICA CLINICA, HEMATOLOGIA, PARASITOLOGIA, BACTERIOLOGÍA, UROANALISIS, COAGULACIÓN, CITOMETRIA H., CITOLOGIA Y PATOLOGÍA.

Así también:

• “EL DIPLOMA ESPECIAL DE RECONOCIMIENTO, POR SU DESEMPEÑO SOBRESALIENTE AL HABER CALIFICADO EN EL AÑO 2010, EN LOS PRIMEROS LUGARES, ENTRE MÁS DE 2550 LABORATORIOS DE TODO EL PAÍS, EN:QUÍMICA CLINICA, BACTERIOLOGÍA, UROANALISIS, CITOMETRIA H., CITOLOGIA Y PATOLOGÍA.

De igual forma:

• “EL RECONOCIMIENTO QUE OTORGA LA UNAM Y EL PACAL, POR:HABER DEMOSTRADO EXCELENCIA EN SU CALIDAD ANALÍTICA Y CALIFICAR ENTRE LOS MEJORES LABORATORIOS CLINICOS MEXICANOS EN EL AÑO 2010.